1 · 光學顯微鏡和倒置顯微鏡
（1） 未染色細胞：凋亡細胞的體積變小、變形，細胞膜無缺但呈現(xiàn)發(fā)泡現(xiàn)象，細胞凋亡晚期可見凋亡小體。貼壁細胞呈現(xiàn)舒展、變圓、墜落。
（2） 染色細胞：常用姬姆薩染色、瑞氏染色等。凋亡細胞的染色質(zhì)濃縮、邊緣化，核膜裂解、染色質(zhì)切割成塊狀和凋亡小體等典型的凋亡形狀。
2 · 熒光顯微鏡和共集合激光掃描顯微鏡
一般以細胞核染色質(zhì)的形狀學改動為目標來評判細胞凋亡的發(fā)展情況。
Hoechst是與DNA特異結(jié)合的活性染料，貯存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度，運用時用PBS稀釋成終濃度為2~5mg/ml。
DAPI為半通透性，用于慣例固定細胞的染色。貯存液用蒸餾水配成1mg/ml的濃度，運用終濃度一般為0.5 ~1mg/ml。
效果評判：細胞凋亡過程中細胞核染色質(zhì)的形狀學改動分為三期：Ⅰ期的細胞核呈波紋狀（rippled）或呈折縫樣（creased），部分染色質(zhì)呈現(xiàn)濃縮情況；Ⅱa期細胞核的染色質(zhì)高度凝集、邊緣化；Ⅱb期的細胞核裂解為碎塊，發(fā)作凋亡小體)。
3 · 透射電子顯微鏡觀察
細胞效果評判：凋亡細胞體積變小，細胞質(zhì)濃縮。凋亡Ⅰ期（pro-apoptosis nuclei）的細胞核內(nèi)染色質(zhì)高度環(huán)繞，呈現(xiàn)許多稱為氣穴現(xiàn)象（cavitations）的空泡結(jié)構(圖2)；Ⅱa期細胞核的染色質(zhì)高度凝集、邊緣化；細胞凋亡的晚期，細胞核裂解為碎塊，發(fā)作凋亡小體。
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